DNA-Metabarcoding im FORTUNA-Projekt

Das Nationalparkamt Hunsrück-Hochwald sucht ein Labor bzw. ein Forschungsteam, das Bodenproben aus dem Nationalpark molekularbiologisch und bioinformatisch untersucht.

Dafür werden DNA-Metabarcoding-Analysen benötigt: Proben werden aufbereitet, DNA wird extrahiert und mit modernen Sequenziermethoden (ITS2 für Pilze, 16S-rRNA für Bakterien) analysiert. Zusätzlich werden bioinformatische Auswertungen und fachliche Beratung erwartet.

Umfang:

Angebotsfrist: 08.09.2026, 10:00 Uhr (elektronisch über den Vergabemarktplatz RLP).

• Wertungspreis20%

  Preiswertung: 40% Gesamtpreis für 150 Proben (Mindestmenge) und 60% rechnerischer Gesamtpreis bei 300 Proben (Gesamtabruf). Niedrigster Wertungspreis erhält 5 Rohpunkte, übrige proportional.

• Q1 – Probenaufbereitung5%

  Darstellung des Verfahrens vom gefrorenen Probenmaterial bis zur Aliquotbildung, Umgang mit Wurzeln/Steinen/Holz/Rinde, ggf. Siebung, Maßnahmen gegen Kreuzkontamination und Probenverwechslung.

• Q2 – Molekularbiologische Analysen15%

  Darstellung der Umsetzung von DNA-Extraktion, ITS2- und 16S-rRNA-Amplikonsequenzierung (Zielregionen, Primer, Replikate, Plattform, Leselänge), Sequenzierumfang (mind. 25.000 Read-Paare je Bibliothek) sowie qPCR-Assays inkl. Kalibrierung und Inhibitionsprüfung.

• Q3 – Bioinformatik und taxonomische Zuordnung15%

  ASV-basiertes Verfahren (z.B. DADA2), Kontaminationsprüfung, Read-Tracking, Referenzdatenbanken (z.B. UNITE), taxonomische Zuordnung sowie ökologische Annotation (z.B. FUNGuild, FungalTraits) für Mykorrhiza, Saprotrophe und Pathogene.

• Q4 – Datenübergabe und Dokumentation5%

  Datenübergabe (FASTQ, FASTA/ASV-Tabelle, taxonomische Zuordnung, Read-Tracking, qPCR-Rohdaten, Mess- und Prozessdaten) in offenen Formaten wie CSV sowie Methoden- und Qualitätsbericht.

• Q5 – Fachliche Beratung20%

  Beratungsumfang (mind. Auftakt-, Zwischen- und Abschlussgespräch, insgesamt mind. 6 Stunden), Besprechungsformate und fachliche Schwerpunkte zu Methoden, Datenqualität und Interpretationsgrenzen.

• Q6 – Erfahrung und Qualifikation20%

  Drei fachlich relevante Referenzprojekte: DNA-Metabarcoding von Bodenproben, Bodenpilze/Mykorrhiza, Waldökosysteme, Störung/Sukzession/Totholz, taxonomische/funktionelle/ökologische Annotation sowie Erfahrung in Großschutzgebieten oder vergleichbaren naturnahen Waldkontexten; zusätzlich Qualifikation der fachlich verantwortlichen Personen.

Wertungspreis P_Wert = 0,4 · P_150 + 0,6 · P_300, wobei P_300 = P_150 + 150 · EP(151-300). Rohpunkte Preis: RP = 5 · (P_Wert_min / P_Wert_eigenes). Gewichtete Punkte: GP = RP/5 · 20. Qualitätskriterien: 0–5 Rohpunkte je Kriterium, GP = RP/5 · jeweilige Gewichtung.