Ausschreibungen Bayern
Ganzgenomsequenzierung NAKO PAIS
Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Vergabekammer des Bundes85764, BayernVeröffentlicht:
Angebotsfrist:
Zusammenfassung
Automatisch erstellt aus den VergabeunterlagenBeschaffung von Sequenzierdienstleistungen für die Ganzgenomsequenzierung von bis zu 28.400 DNA-Proben im Rahmen des Forschungsprojekts NAKO PAIS (Nationale Dekade gegen postinfektiöse Erkrankungen). Der Auftrag umfasst zwei Tranchen: eine Pflicht-Tranche über 23.400 Proben und eine optionale Tranche über bis zu 5.000 weitere Proben.
Gefordert sind PCR-freie Library Preparation, Sequenzierung mit Illumina NovaSeq X Plus (150 bp paired-end), interne Qualitätskontrolle sowie Lieferung der Sequenzierrohdaten und technischer Metadaten in Illumina ICA-Base. Bei Nichterreichen der Qualitätsparameter ist die Wiederholung kostenlos.
Vergeben wird im Offenen Verfahren durch das Helmholtz Zentrum München. Angebote sind ausschließlich elektronisch über www.evergabe.de bis zum 06.10.2026 um 11:00 Uhr einzureichen.
Zeitplan & Fristen
Aus den Vergabeunterlagen extrahiertTermin / FristSEP2026 NOV JAN2027 MÄR MAI JUL SEP NOV
Veröffentlichungca. 15. Sep. 2026
Rügefristca. 26. Sep. – 6. Okt. 2026
Bieterfragen-Frist28. Sep. 2026
Angebotsfrist6. Okt. 2026
Angebotsöffnung6. Okt. 2026
Bürgschaftsnachweisca. 2. Nov. – 7. Nov. 2026
Zuschlag2. Nov. 2026
Bindefrist2. Nov. – 31. Dez. 2026
Vertragsbeginn2. Nov. 2026
Vorauszahlungsrechnung Tranche 12. Nov. – 30. Nov. 2026
Tranche 2 Abruffrist2. Nov. 2026 – 2. Nov. 2027
Vertragslaufzeitca. 2. Nov. 2026 – 2. Aug. 2027
Regelmäßige Abstimmung (erste 2 Monate)ca. 2. Nov. 2026 – 2. Jan. 2027
Nachprüfungsantragca. 2. Nov. – 17. Nov. 2026
Produktionsstart Tranche 12. Jan. – 1. März 2027
Lieferzeit Tranche 1ca. 2. Jan. – 1. Dez. 2027
Regelmäßige Abstimmung (danach)ca. 2. Jan. – 1. Dez. 2027
Monatliche Fortschrittsberichteca. 15. Feb. – 15. Dez. 2027
Nachweis Vernichtung Probenresteca. 1. Dez. – 29. Dez. 2027
Datenlöschung nach Projektendeca. 1. Dez. 2027
Verjährungsfrist Mängelansprücheca. 1. Dez. 2027 – 1. Dez. 2029bis 2029
vor Angebotsabgabenach Angebotsabgabegeschätzt
Zuschlagskriterien
Gewichtung laut VergabeunterlagenRichtwertmethode7 Kriterien
- B 10 Versandspezifikationen
Gewünschtes Versandformat (Konzentration, Volumen, Trockeneis), nicht obligatorisch
- B 11 Labor & Mindestdurchsatz für TRANCHE 1
Benennung des Labors und garantierter monatlicher Mindestdurchsatz für Tranche 1 (gestaffelte Punktevergabe von 0 bis 10)
- B 12 Produktionsstart für TRANCHE 1
Garantierter Produktionsstart nach Erhalt der ersten Probe (10 Pkt: 1 Monat, 5 Pkt: bis 3 Monate, 0 Pkt: > 3 Monate)
- B 13 Labor & Mindestdurchsatz für TRANCHE 2
Benennung des Labors und garantierter monatlicher Mindestdurchsatz für Tranche 2 (gestaffelte Punktevergabe von 0 bis 10)
- B 14 Produktionsstart für TRANCHE 2
Garantierter Produktionsstart nach Erhalt der ersten Probe für Tranche 2 (10 Pkt: 1 Monat, 5 Pkt: bis 3 Monate, 0 Pkt: > 3 Monate)
- B 15 Konzept Vorgehen & Durchsatz
Konzept zu methodischen/technischen Schritten (Probentransport, -annahme, -verarbeitung), Durchsatz und maschineller Ausstattung, Prozess zu Wiederholung/Resequenzierung, Datentransfer und -löschung, Darstellung anhand eines vergleichbaren Referenzprojekts (Bewertung 0, 2, 4, 6, 8, 10 Punkte)
- B 16 Konzept Wertebereiche, Grenzwerte und Qualitätssicherungsmaßnahmen
Konzept zu Qualitätssicherungsmaßnahmen, dokumentierten Variablen, erwarteten Wertebereichen und Grenzwerten sowie Maßnahmen bei Abweichungen (Bewertung 0, 2, 4, 6, 8, 10 Punkte)
Einfache Richtwertmethode nach UfAB 2018: Kennzahl Z = Leistungspunkte / Preis, multipliziert mit Skalierungsfaktor 100.000. Das Angebot mit dem höchsten Ergebnis ist das wirtschaftlichste. Bei absolut gleichen Ergebnissen erhält das preisgünstigste den Zuschlag.
KI-Hinweis: Alle Zuschlagskriterien und Gewichtungspunkte sind im Leistungsverzeichnis vollständig dokumentiert. Die Bewertung erfolgt nach einfacher Richtwertmethode (Z = Leistungspunkte/Preis, Faktor 100.000), bestätigt in Bieterfrage 31. Die Bekanntmachung nennt 50%/50% Preis/Leistung; laut Vergabeunterlagen (LV) und Bieterantwort gilt jedoch die Richtwertmethode ohne separate Preisgewichtung – die Vergabeunterlagen haben Vorrang. Die Gewichtungen sind in den Unterlagen nicht eindeutig lesbar (z. B. Formularfelder ohne Zuordnung).
Leistungsumfang
Aus den VergabeunterlagenProbenmaterial und Anlieferung
Probenmaterial: Aus Buffy Coats automatisch extrahierte humane DNA (Chemagic Prime 8 System).
Konzentration: mindestens 20 ng/µl (Zielwert 20–60 ng/µl)Reinheit: A260/A280 = 1,75–2,05Lagerung: Tris(hydroxymethyl)aminomethan bei -80 °CVersand: maximal 1.500 ng DNA pro Probe in 96-Well-PCR-Platten auf TrockeneisMindestens 500 ng DNA pro ReaktionProbeneingangskontrolle und -dokumentation gemäß Anlage Tabelle 01 NAKOPAIS (Spalten A–G)
Technologische Vorgaben (Ausschlusskriterien)
Zwingend vorgeschriebene Technik und Materialien – Abweichungen führen zum Ausschluss:
Sequenziergerät: Illumina NovaSeq X PlusReagenzien-Kit: NovaSeq X Series 25B Reagent Kit 300 cycles (Kat.-Nr. 20104706)Library Preparation: Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 samples) (Kat.-Nr. 20041795)Indexes: Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A–D, Tagmentation (96 Indexes) (Kat.-Nr. 20091654, 20091656, 20091658, 20091660)Read-Modus: 150 bp paired-endAusschließlich Originalreagenzien von IlluminaKeine Änderungen an Technologie, Chemie, Library Preparation oder zentralen Prozessparametern während der Projektlaufzeit ohne vorherige schriftliche Zustimmung des Auftraggebers
Leistungsschritte im Pflichtumfang
1. Annahme und Eingangskontrolle der DNA-Proben
2. PCR-freie Library Preparation
3. Ganzgenomsequenzierung (Illumina NovaSeq X Plus, 150 bp paired-end)
4. Interne Qualitätskontrolle der Sequenzierleistung
5. Lieferung der Sequenzierrohdaten in Illumina ICA-BASE im BCL-Format inkl. vollständiger Sample Sheets
6. Lieferung definierter technischer Metadaten in Illumina ICA-BASE
7. Dokumentation der Proben-, Library-, Run- und Datenlieferungsprozesse gemäß Anlage Tabelle 01 NAKOPAIS
8. Monatliche Fortschrittsberichte (jeweils bis zum 15. des Folgemonats)
9. Abstimmung mit Auftraggeber und Datenprozessierer: 2-wöchentlich in den ersten 2 Monaten, danach monatlich
Qualitätsanforderungen
Ausschlusskriterien (Mindestwerte):
Genomweite Coverage mindestens 30,0x pro Einzelprobe (nicht als Durchschnitt)Sample Yield > 100 GB pro ProbeGenomanteil mit Coverage > 15x ≥ 90 %Bei verfehlten Proben: einmalige vollständige Wiederholung + zweimalige Resequenzierung (z. B. Spike-in) zulässig; Proben, die auch danach keine 30x Coverage erreichen, werden nicht vergütetBei vom Auftragnehmer verursachten Qualitätsmängeln: kostenlose Wiederholung
Zielwerte für QM:
Duplication rate ≤ 15 %Median Insert size ≥ 300 bpPF % aligned ≥ 85 %Callability ≥ 95 %Contamination rate < 2 % (gemeinsame Prüfung)
Datenlieferung und Schnittstelle
Upload der Sequenzierrohdaten im BCL-Format in die Illumina ICA-BASE des AuftraggebersVollständige und korrekte Sample SheetsEindeutige, konsistente, maschinenlesbare Sample-IDsKeine eigenmächtige Änderung von ProbenkennungenVorab vereinbarte Verzeichnis- und DateistrukturUnterstützung der Konnektivität zu IlluminaUnverzügliche Löschung lokal gespeicherter Rohdaten nach erfolgreicher Übertragung
Datenschutz, Informationssicherheit und Standort
Verarbeitung gemäß DSGVO (insbesondere Art. 9 Abs. 1 – genetische Daten als besondere Kategorie)Ausschließlich Verarbeitung in EU/EWR – dies umfasst Speicherung, Administration, Wartung, Support und DatensicherungKeine Übermittlung und keine Zugriffe aus Drittländern (auch keine Remote-Zugriffe)Auftragsverarbeitungsvertrag (AVV) gemäß Art. 28 DSGVO vor BeginnTechnisch-organisatorische Maßnahmen (TOM) gemäß Art. 32 DSGVO vor VertragsabschlussUnterauftragsverarbeiter nur mit schriftlicher Zustimmung und ausschließlich in EU/EWROffenlegungspflicht bei ausländischen Rechtsvorschriften, die Zugriffe ermöglichen könntenVerschlüsselung während Speicherung und Übertragung nach Stand der TechnikZugriffsprotokollierung und ManipulationsschutzUnverzügliche Information des Auftraggebers bei BehördenzugriffenVernichtung des Restmaterials nach Absprache; Nachweis innerhalb von 4 WochenUnverzügliche Löschung aller Daten nach Projektabschluss, soweit keine gesetzliche Aufbewahrungspflicht besteht
Projektorganisation und Berichtswesen
Benennung fachlicher und organisatorischer AnsprechpartnerRegelmäßige Abstimmung: alle 2 Wochen in den ersten 2 Monaten, danach monatlichMonatliche Fortschrittsberichte bis zum 15. des Folgemonats (für beide Tranchen)Unverzügliche Mitteilung bei Kapazitätsengpässen
Nicht im Auftrag enthalten
Alignment, Variant Calling, Joint GenotypingErstellung finaler Analyseprodukte (CRAM, gVCF, VCF, msVCF)Datenmanagement in Illumina ICA-BASEWissenschaftliche Auswertung der SequenzdatenBioinformatische Datenprozessierung in Illumina ICA mit DRAGEN
Versicherung und Bürgschaft
Nachweis einer Berufs-/Betriebshaftpflichtversicherung mit Mindestdeckungssummen: 5 Mio. EUR für Personenschäden und 2,5 Mio. EUR für sonstige Schäden pro SchadensfallVorauszahlungsbürgschaft für TRANCHE 1: selbstschuldnerisch, unbefristet, in Höhe der Vorauszahlung
Tranchen im Überblick
TRANCHE 1 (Pflicht): 23.400 Proben, max. 9 Monate ab Erhalt der ersten Probe, Produktionsstart spätestens am 01.03.2027. Vorauszahlung 100 % des Gesamtpreises gegen Bürgschaft; Rechnung bis 30.11.2026.TRANCHE 2 (Option des Auftraggebers): bis zu 5.000 weitere Proben, Abruf im Anschluss an TRANCHE 1 oder im Jahr 2028. Für den Auftraggeber optional, für den Bieter verpflichtend zu erbringen. Zahlung nach Abruf auf Rechnung. Fehlende Preisangabe führt zum Ausschluss.
Eignungskriterien
Geforderte Nachweise laut VergabeunterlagenAusschlusskriterien – Zwingend zu erfüllen
A1 Probenumfang und Probentyp: Sequenzierung von 23.400 Proben (TRANCHE 1) + optional 5.000 (TRANCHE 2); Versandvorgaben (1.500 ng DNA, 96-Well-PCR-Platten, 500 ng/Reaktion); Dokumentation der Eingangsqualitätskontrolle gemäß Anlage Tabelle 01 Spalten A–GA2 Technologie und Materialien: Illumina NovaSeq X Plus, 25B Reagent Kit 300 cycles, PCR-freie Library Preparation, 150 bp paired-end; ausschließlich Originalreagenzien von Illumina; keine Änderungen ohne ZustimmungA3 Sequenzierziel und Qualität: mind. 30,0x Coverage pro Einzelprobe, Yield > 100 GB, ≥ 90 % Genom mit > 15x; Abnahme nach QC-RückmeldungA4 Datenlieferung und Schnittstelle: Upload im BCL-Format in Illumina ICA-BASE; vollständige Sample Sheets; eindeutige Sample-IDs; vereinbarte VerzeichnisstrukturA5 Wiederholung und Resequenzierung: kostenlose Wiederholung bei vom Auftragnehmer verursachten Mängeln; Proben ohne 30x Coverage werden nicht vergütetA6 Zeitplan und Durchsatz: TRANCHE 1 in max. 9 Monaten ab erster Probe; Produktionsstart spätestens 01.03.2027; monatliche Fortschrittsberichte bis zum 15. des FolgemonatsA7 Datenschutz, Informationssicherheit und Standort: ausschließlich EU/EWR-Verarbeitung; AVV (Art. 28 DSGVO) und TOM (Art. 32 DSGVO); keine Drittlandzugriffe; Standorte, Konzernunternehmen und Unterauftragsverarbeiter offenzulegenA8 Projektorganisation: Ansprechpartner benennen; 2-wöchentliche (erste 2 Monate) bzw. monatliche Abstimmung; FortschrittsberichteA9 Bürgschaft für TRANCHE 1: Eigenerklärung im Angebot; Nachweis durch Bürgen vor Zuschlag (5 Kalendertage nach Aufforderung)
Persönliche Eignung und Ausschlussgründe
Eintragung im Handelsregister oder Bestätigung der Nicht-VerpflichtungKein Insolvenzverfahren, keine Liquidation, keine MasseablehnungKeine schweren Verfehlungen (u. a. Betrug, Bestechung, Diebstahl, wettbewerbsbeschränkende Absprachen, Umweltdelikte) – Strafen über 3 Monate Freiheitsstrafe oder 90 Tagessätze Geldstrafe in den letzten 2 JahrenOrdnungsgemäße Zahlung von Steuern, Abgaben und SozialversicherungsbeiträgenScientology-Erklärung: keine Anwendung/Verbreitung von L. Ron Hubbard-TechnologieRussland-Sanktionen (Art. 5k EU-VO 833/2014): keine russischen Staatsangehörigen, keine Niederlassung in Russland, keine > 50 %-Beteiligung durch Russland, kein Handeln im Auftrag Russlands; gleiches für Unterauftragnehmer mit > 10 % AuftragswertGewerbezentralregister-Auszug (§ 150a GewO) ab Auftragssumme ≥ 30.000 EUR
Fachliche Eignung und Qualifikation
Unternehmensdarstellung: Name, Geschäftsführer, Geschäftssitz, alle Niederlassungen, GesellschaftsformProjektleiter-Profil: Name, Ausbildung, Werdegang, Weiterbildungen; Englisch verhandlungssicher in Wort und SchriftZertifizierung: gültige ISO/IEC 17025 oder vergleichbarEinsatz des im Verfahren benannten Projektteams: Projektleiter nur mit Zustimmung des Auftraggebers austauschbar; Team in Anzahl und fachlicher Qualifikation ausreichend
Bewertungskriterien (B-Kriterien)
B10 Versandspezifikationen (5 GP): Konzentration 20–60 ng/µl; Volumen 15–45 µl; Versand auf Trockeneis erwünschtB11 Labor & Mindestdurchsatz TRANCHE 1 (20 GP): Benennung Labor; garantierter monatlicher Mindestdurchsatz (Bestnote 10 Pkt ab 3.905, 0 Pkt unter 2.600)B12 Produktionsstart TRANCHE 1 (20 GP): 10 Pkt bei 1 Monat, 5 Pkt bei >1–3 Monaten, 0 Pkt bei >3 MonatenB13 Labor & Mindestdurchsatz TRANCHE 2 (5 GP): gleiche Skala wie B11B14 Produktionsstart TRANCHE 2 (5 GP): gleiche Skala wie B12B15 Konzept Vorgehen & Durchsatz (500 GP): max. 5 Seiten, Arial 11pt, 1,5-zeilig; Beschreibung von Methode, Durchsatz, Geräteausstattung, Wiederholungsprozess, Datentransfer/-löschung; Darstellung anhand eines realisierten Referenzprojekts (srWGS, PCRfree, vergleichbare Probenanzahl und Zeitraum)B16 Konzept Wertebereiche, Grenzwerte & Qualitätssicherung (200 GP): max. 5 Seiten, Arial 11pt, 1,5-zeilig; QS-Maßnahmen, dokumentierte Variablen, erwartete Wertebereiche/Grenzwerte, Maßnahmen bei Abweichungen
Gesamtgewichtung: 755 GP (0 Ausschluss + 55 B + 700 C)
Datenschutz- und IT-rechtliche Anforderungen
Auftragsverarbeitungsvertrag (AVV) gemäß Art. 28 DSGVO inkl. technisch-organisatorischer Maßnahmen (TOM) gemäß Art. 32 DSGVO vor VertragsbeginnVerpflichtung zur Einhaltung des Bundestariftreuegesetzes (BTTG)Informationssicherheitsformblatt: Angaben zu Standorten, Konzernunternehmen, Maßnahmen gegen konzerninterne/grenzüberschreitende Zugriffe, Verschlüsselungs- und AuthentifizierungsverfahrenKeine Verarbeitung und keine Zugriffe außerhalb EU/EWR; keine Remote-Zugriffe aus Drittländern
Finanzielle und vertragliche Anforderungen
Bereitschaft zur Stellung einer selbstschuldnerischen, unbefristeten Vorauszahlungsbürgschaft für TRANCHE 1Nachweis einer Berufs-/Betriebshaftpflichtversicherung: 5 Mio. EUR Personenschäden, 2,5 Mio. EUR sonstige Schäden pro SchadensfallKeine Eignung als KMU (`suitableforsmes: false`)
Referenzprojekte
1 ReferenzenZeitraum: vergleichbarer Zeitraum zum ausgeschriebenen ProjektVolumen: vergleichbare Probenanzahl (ca. 23.400–28.400 Proben)
Darstellung des Vorgehens anhand eines realisierten Referenzprojekts im Konzept B15
srWGS (short-read Whole Genome Sequencing) mit PCRfree-Protokoll; vergleichbare Probenanzahl und vergleichbarer Zeitraum; Rückschlüsse auf Herangehensweise im Auftragsfall müssen möglich sein
KI-Hinweis: Alle Eignungskriterien wurden per KI aus den Vergabeunterlagen extrahiert. Mit TendiGo prüfen Sie in wenigen Minuten, ob Ihr Unternehmen die Anforderungen erfüllt.
Wettbewerb & Angebotsprognose
Erwartete Konkurrenz auf Basis vergleichbarer Vergaben1–3Angebote erwartet
Median vergleichbarer Vergaben: rund 2 Angebote
Wahrscheinliche Bieterzahl
1–3 · 75%4–10 · 24%11+ · 1%
Checkliste zur AngebotsabgabeKonkrete Schritte laut Vergabeunterlagen0 von 19 erledigt
Pflichtdokumente mit dem Angebot
Bedingt einzureichende Unterlagen
Technische Konzepte (Vertragsbestandteil, keine Preise)
Vor Zuschlagserteilung zu erledigen
Mit TendiGo
Finden Sie weitere passende Ausschreibungen und prüfen Sie mit KI, ob Ihr Unternehmen die Anforderungen erfüllt.
Zur Original-Ausschreibung ↗Auf einen Blick
Auftraggeber
Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Vergabekammer des Bundes
Anschrift
85764 Neuherberg
Ort
Neuherberg 85764
Kategorie
Bayern
Veröffentlicht
Angebotsfrist
Auftraggeber-Website
www.bundeskartellamt.de ↗Erfüllungsort
Ort der Leistung
Neuherberg 85764
Bayern
Weitere Ausschreibungen Bayern
Alle anzeigen →Bayern
IT-Dienstleistungen zur ECM-Weiterentwicklung und zum ECM-Betrieb 2027 (ECM-W-B 2027)
Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V., Max Planck Information and Technology (MaxIT) · Kreisfreie Stadt MünchenFrist: BayernIsolierarbeiten an technischen Anlagen
Staatliches Bauamt Regensburg · 93426 RodingFrist: BayernGehoelzpflanzungen Herbst 2026
Staatliches Bauamt Freising · 85354 FreisingFrist: BayernSpielplatzgeraete - Gemeinde Eresing
ZV KD Oberland Zentrale Beschaffungsstelle · 86922 EresingFrist: BayernAnbau Grundschule - Gemeinde Kruen - Schlosserarbeiten
ZV KD Oberland Zentrale Beschaffungsstelle · 82494 KruenFrist: BayernGeb. 43 Gaswarnanlage
Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) · 85764 Oberschleißheim OT NeuherbergFrist:Bereit für die Zukunft der Vergabe?
Setzen Sie auf den neuen technologischen Standard und verschaffen Sie sich den entscheidenden Vorsprung in der Auftragsakquise.
806+ VergabequellenMit Experten entwickeltSofort einsatzbereit