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Bereitstellung einer Software für die sekundäre und tertiäre Genomanalyse

Charité Universitätsmedizin Berlin | Charité Universitätsmedizin Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Datenservice Öffentlicher Einkauf (in Verantwortung des Beschaffungsamts des BMI)Berlin, BerlinVeröffentlicht:
Angebotsfrist:

Zusammenfassung

Automatisch erstellt aus den Vergabeunterlagen

Die Charité – Universitätsmedizin Berlin beschafft im offenen Verfahren eine cloudbasierte Software für die sekundäre und tertiäre Genomanalyse.

Die Lösung soll Genom-Rohdaten automatisiert auswerten, Varianten erkennen (SNVs, Indels, CNVs, Strukturvarianten, Short-Tandem-Repeats) und klinische Befunde erstellen. Sie muss auf Servern in Deutschland gehostet werden, mit dem Illumina NovaSeq X Plus und Illumina DRAGEN kompatibel sein und hohe Sicherheitsstandards (C5-Testat, ISO 27001) erfüllen.

Bieter müssen drei vergleichbare Unternehmensreferenzen aus den letzten drei Jahren vorlegen, zwei davon mit mindestens 10 Nutzern und eine mit mindestens 1.000 durchgeführten Analysen.

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Zeitplan & Fristen

Aus den Vergabeunterlagen extrahiert
Angebotsfrist: 18. September 2026
Termin / FristAUG2026 FEB AUG FEB AUG FEB AUG FEB AUG
Bieterfragen-Frist26. Aug. 2026
Angebotsfrist4. Sep. 2026
Bindefrist9. Okt. 2026
Verifizierende Teststellungca. 9. Okt. – 30. Okt. 2026
Ausführungsbeginnca. 9. Okt. 2026
Implementierungca. 9. Okt. – 6. Nov. 2026
Vorlaufzeit Personalwechselca. 9. Okt. 2026 – 6. Nov. 2030bis 2030
Vertragslaufzeitca. 9. Okt. 2026 – 6. Nov. 2030bis 2030
Mindestvertragslaufzeitca. 6. Nov. 2026 – 6. Nov. 2028
Verlängerung 1ca. 6. Nov. 2028 – 6. Nov. 2029
Verlängerung 2ca. 6. Nov. 2029 – 6. Nov. 2030bis 2030
Kündigungsfrist Auftragnehmerca. 6. Feb. 2030
Kündigungsfrist Auftraggeberca. 6. Aug. 2030
vor Angebotsabgabenach Angebotsabgabegeschätzt

Zuschlagskriterien

Gewichtung laut Vergabeunterlagen
Preis & Qualität3 Kriterien
Preis 40%Qualität 60%
  • Niedrigster Preis40%

    Angebotspreis gemäß Preisblatt. Niedrigster Preis erhält 40 Punkte, andere nach Dreisatz-Formel (geringster Preis / eigener Preis x 40).

  • KANN-Anforderungen30%

    Bewertung wünschenswerter Funktionen aus dem Anforderungskatalog. Antwortkategorien: A (10 Punkte - verfügbar), B (5 Punkte - bis Ende Implementierungsphase verfügbar), C (0 Punkte - nicht verfügbar). Max. 50,0 Rohpunkte. Umrechnung per Dreisatz auf 30 Punkte.

  • Produkt- und Umsetzungskonzept30%

    Bewertung des vom Bieter einzureichenden Konzepts (max. 10 Seiten). Max. 50,0 Rohpunkte aus 5 Unterkriterien (je 0-10 Punkte). Umrechnung per Dreisatz auf 30 Punkte.

Preis: Punkte = geringster Preis / eigener Preis x 40. KANN-Anforderungen und Produkt- und Umsetzungskonzept: jeweils Dreisatz-Formel: 30 x eigene Punkte / höchste Punktzahl. Gesamtpunktzahl = Summe der drei Kriterien.

KI-Hinweis: Alle Zuschlagskriterien inkl. Gewichtungen und Bewertungsformeln sind vollständig im Dokument angegeben. Die Unterkriterien des Produkt- und Umsetzungskonzepts sind flach (gleiche Gewichtung) ohne hierarchische Aufteilung, daher als sonstige Kriterien ohne prozentuale Gewichtung dargestellt.

Leistungsumfang

Aus den Vergabeunterlagen

Bereitstellung & Implementierung

Bereitstellung einer cloud-basierten Analyse-Plattform (SaaS)Vollständige Implementierung und Gesamtkonfiguration in Zusammenarbeit mit der Charité, innerhalb von 20 Arbeitstagen nach ZuschlagTechnische Dokumentation über eine WebsiteAnbindung an das Charité-Kernnetzwerk über VPN (redundant)Dedizierte, ungeteilte Verbindung mit mindestens 1 GB/s Port-GeschwindigkeitVollständiger Datenimport und -export jederzeit möglichKompatibilität mit Illumina NovaSeq X Plus und Illumina DRAGEN

Sekundäranalyse – Funktionen

Alignment gegen ein aktuelles Referenzgenom (Referenzgenom auswählbar)Erkennung von SNVs und IndelsErkennung von CNVs und StrukturvariantenErkennung von Short-Tandem-RepeatsUnterstützung der Datenformate bam/cramVerarbeitung von FASTQ-Rohdaten aus dem lokalen SODAR-SystemAlle Analysenparameter durch Charité-Mitarbeiter anpassbar

Tertiäranalyse – Funktionen

Einbezug aktueller Referenzdatenbanken, populationsgenetischer Daten, krankheitsassoziierter Varianten, Gen-Phänotyp-Beziehungen und wissenschaftlicher LiteraturKI-gestützte Filter- und Priorisierungsmechanismen (graphbasiert, erklärbar)Verwendung standardisierter Phänotyp-Ontologien (HPO o. ä.)ACMG-Klassifikation der VariantenRevisionssichere Dokumentation aller BewertungenErneute Annotation von VCF-DateienArchivierung genomischer Daten in der CloudRegelmäßige Aktualisierung der VariantendatenbankAnpassbare Berichte, Export in maschinenlesbarer Form und nach LIMS der Charité

Datenspeicherung & Hosting

Speicherung und Verarbeitung ausschließlich auf Servern in Deutschland (Pflicht)Sekundärdaten (BAM, VCF, QC, Logs) bis zum Abschluss aller Re-Analysen zwischengespeichertTertiärdaten langfristig/unbegrenzt gespeichertAnnotationsstand zum Zeitpunkt jeder Auswertung versioniert gespeichertDynamischer, kostenbasierter Speicher je nach Analyseanzahl

Wartung, Support & Verfügbarkeit

3-stufiges Support-Modell (1st/2nd/3rd Level)Erreichbarkeit der deutschsprachigen Ansprechperson: Mo–Fr 08:00–17:00 UhrTelefonischer Support 2nd/3rd Level: Mo–Fr 08:00–18:00 UhrVerfügbarkeit ≥ 99,5 % pro KalendermonatMittlere Antwortzeit ≤ 1 Sekunde (über 30 Tage)Reaktions-/Wiederherstellungszeiten je nach Störungsklasse (schwerwiegend: 4 h / 24 h; erheblich: 8 h / 24 h; leicht: 48 h / 72 h)Updates, Patches, Bugfixes, Sicherheitsupdates, automatische UpgradesHotfixes bei systemseitigen FehlernTLS 1.2 / BSI TR 02102-2; C5-Basiskriterien; Backup aller Auftraggeberdaten (Protokolle mind. 6 Monate)

Schulung & Wissenstransfer

Remote-Schulungen für mindestens 30 Administratoren/AnwenderDigitale Schulungsunterlagen und Dokumentationen

Optionale Leistungen (auf Abruf)

+200 zusätzliche Genom-Analysen (bioinformatische Prozessierung)+200 zusätzliche Speicher-/Datentransfer-Einheiten+10 zusätzliche Nutzer+15 Personentage technische Entwicklungsleistung (Systemarchitekten/Programmierer)Bei Wechsel im Projektteam: mindestens 4 Wochen schriftliche Vorankündigung; Charité hat Widerspruchsrecht

Eignungskriterien

Geforderte Nachweise laut Vergabeunterlagen

Mindestanforderungen – Referenzen & Zertifizierungen

Alle Mindestanforderungen sind exakt zu erfüllen – es gibt keine Toleranzen. Nichterfüllung führt zum Angebotsausschluss.

3 Unternehmensreferenzen aus den letzten 3 Jahren (2023, 2024, 2025 oder aktueller) über vergleichbare Leistungen (Bereitstellung einer Software für die sekundäre und tertiäre Genomanalyse)Mindestens 2 davon mit ≥ 10 NutzernMindestens 1 davon mit ≥ 1.000 durchgeführten AnalysenC5-Testat Typ 1 (oder gleichwertiger Sicherheitsnachweis) für den spezifischen Cloud-DienstISO 27001:2013-Zertifizierung (oder gleichwertig) für die angebotene Cloud-Infrastruktur

Nachweise jeweils als Kopie bzw. über das Formblatt der Charité.

Personelle Anforderungen

Mindestens zwei namentlich benannte Personen in leitender Funktion (inkl. Stellvertretung)Beide müssen nachweisen:> 3 Jahre Berufserfahrung in der Auswertung humangenetischer DatenMindestens eine Person (Projektleitung) muss zusätzlich nachweisen:> 2 Jahre technische Berufserfahrung in Betriebsunterstützung, Implementierung und Auswertung genomischer DatenNachweis über Eigenerklärung (Lebensläufe) und Referenzen/ProjektbeschreibungenSämtliche Ressourcen des Bieters erbringen Leistungen in deutscher Sprache (mind. C1)

Technische & organisatorische Anforderungen

Software muss für humane Genomdaten etabliert und regelmäßig gepflegt/weiterentwickelt seinKompatibilität mit Illumina NovaSeq X Plus und Illumina DRAGENDedizierte, ungeteilte Verbindung mit mind. 1 GB/s Port-GeschwindigkeitVPN-Anbindung an Active Directory (redundant)Datenverarbeitung ausschließlich in DeutschlandTLS 1.2 / BSI TR 02102-2; C5-BasiskriterienBarrierefreiheit nach BIKTG Bln (Nachweis spätestens vor Software-Abnahme)Backup aller AuftraggeberdatenSchriftliche Vorankündigung von 4 Wochen bei Wechsel des Projektteams (Widerspruchsrecht der Charité)

Ausschlussgründe & Compliance

Keine zwingenden oder fakultativen Ausschlussgründe nach §§ 123, 124 GWB (u. a. schwere Verfehlung, Insolvenz, Verstöße gegen Umwelt-/Sozial-/Arbeitsrecht, mangelhafte Auftragserfüllung, Täuschung)Keine Eintragungen im WettbewerbsregisterEinhaltung der FrauenförderverordnungBietergemeinschaften sind zulässig (gesamtschuldnerische Haftung); Unterauftragnehmer zulässig (Hauptauftragnehmer haftet allein)Nebenangebote sind nicht zugelassen
Referenzprojekte
3 Referenzen aus den letzten 3 Jahren (2023, 2024, 2025 oder aktueller) ReferenzenZeitraum: 2023–2025 oder aktuellerVolumen: Mind. 2 Referenzen mit ≥10 Nutzern; mind. 1 Referenz mit ≥1.000 durchgeführten Analysen

Bereitstellung einer Software für die sekundäre und tertiäre Genomanalyse

Vergleichbare Leistung; Nachweis über beigefügtes Formblatt der Charité (Eigenerklärung zu Unternehmensreferenzen)

KI-Hinweis: Alle Eignungskriterien wurden per KI aus den Vergabeunterlagen extrahiert. Mit TendiGo prüfen Sie in wenigen Minuten, ob Ihr Unternehmen die Anforderungen erfüllt.

Wettbewerb & Angebotsprognose

Erwartete Konkurrenz auf Basis vergleichbarer Vergaben
1–3Angebote erwartet
Median vergleichbarer Vergaben: rund 2 Angebote
Geringe Konkurrenz
Wahrscheinliche Bieterzahl
1–3 · 45%4–10 · 28%11+ · 26%
Checkliste zur AngebotsabgabeKonkrete Schritte laut Vergabeunterlagen0 von 19 erledigt
Pflichtunterlagen – Angebotsformulare
Pflichtnachweise – Eignung & Compliance
Pflichtnachweise – Technik & Personal
Nur bei Bietergemeinschaft / Unteraufträgen

Verlauf dieser Vergabe

4 Bekanntmachungen
  1. 01.09.2026Ausschreibungauf dieser Seite
    • Abgabefrist: 31.08.2026 → 18.09.2026
  2. 23.08.2026Ausschreibung
  3. 04.08.2026Ausschreibung
    • Titel geändert
    • Beschreibung geändert
  4. 01.08.2026Ausschreibung
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Auf einen Blick

Auftraggeber
Charité Universitätsmedizin Berlin | Charité Universitätsmedizin Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Vergabekammer des Landes Berlin | Datenservice Öffentlicher Einkauf (in Verantwortung des Beschaffungsamts des BMI)
Anschrift
13353 Berlin
Ort
13353 Berlin
Kategorie
Berlin
Veröffentlicht
Angebotsfrist
Auftraggeber-Website
https://charite.de ↗

Erfüllungsort

Ort der Leistung
13353 Berlin
Berlin

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